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          白菜種傳黑斑病菌rDNA ITS區序列分析


          【發布日期】:2018-03-21  【來源】:菌物學報
          【作者】肖長坤 鄭建秋 李健強 師迎春 Hasan Bolkan
          【機構】北京市植物保護站 中國農業大學農學與生物技術學院植物病理系中國農業大學農學與生物技術學院植物病理系 北京100029北京100019 北京100019Campbell Researchand Development Campbell Soup CompanyDavisCA95616USA.
          【摘要】本文以來自國內外的20株白菜黑斑病菌及近源種為研究材料,進行了5.8SrDNA及其側翼ITS區的克隆、測序、序列變異及遺傳進化關系分析。黑斑病菌及其近源種真菌核糖體5.8SrDNA及其側翼ITS區序列比對結果顯示,不同種菌株ITS1比ITS2在堿基構成上有更大變異,而且ITS1的序列長度變異比ITS2的大;而種內雖然各菌株的寄主和地理來源不同,但ITS1和ITS2在長度上均沒有變異,堿基構成上存在微小的變異。對該區序列的聚類分析表明,白菜黑斑病菌3個種蕓薹鏈格孢Alternariabrassicae、甘藍鏈格孢A.brassicicola和蘿卜鏈格孢A.japonica雖然地理來源和寄主不同,但種內的不同菌株均在一個獨立的聚類組中,種之間以及其和鏈格孢屬內其它種在聚類關系上能明顯分開,可基于該區進行黑斑病菌的分類鑒定。 
          【基金】國家“十五”科技攻關計劃專題項目(編號2002BA516A08-11)部分內容;
          【關鍵詞】聚類分析; 分類鑒定; A.brassicae; A.brassicicola; A.japonica;
          黑斑病菌及其近源種 5.8S rDNA 側翼 ITS1 聚類分析樹狀圖
          黑斑病菌及其近源種 5.8S rDNA 側翼 ITS2 聚類分析樹狀圖
           
          關鍵詞: 聚類分析 分類鑒定
           
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