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          肺形側耳線粒體基因組多態性鑒定


          【發布日期】:2019-01-26  【來源】:菌物學報
          【作者】葉麗云 孟國良 程冰 趙麗麗 解凡 吳小平
          【機構】福建農林大學菌物研究中心
          摘要:線粒體是能量轉化與ATP形成的重要場所,已有多種食用真菌的線粒體基因組被相繼組裝注釋,但肺形側耳的線粒體基因組鮮有報道。本研究對野生肺形側耳X2菌株的線粒體基因組進行組裝并注釋,由野生菌株X2與主栽菌株JX線粒體大片段差異序列,構建分子標記來鑒別野生和主栽肺形側耳菌株。結果顯示X2的線粒體基因組為大小75 709bp的閉合環狀結構,含有r RNA的大小亞基基因,25個負責攜帶氨基酸的t RNA基因以及14個常見蛋白編碼基因,在cox1基因上含有9個內含子。內含子主要為IB型,包含LAGLIDADG1 superfamily、GIY-YIGCterm superfamily保守結構域。位于菌株X2與JX內含子和基因間區上的大片段差異序列,是造成種內線粒體多態性的主要因素。根據兩菌株的差異片段構建系統進化樹的結果顯示,內含子、rnl-trn X、trn D-atp6序列能夠將兩株野生菌株和其他主栽菌株區分開,可用于野生肺形側耳種內鑒定,而且trn D-atp6效果最佳。 
           
          基金:秀珍菇品種選育及安全高效關鍵技術研究(KS115009A)~~;
           
          關鍵詞:野生肺形側耳; 線粒體基因組; 多態性; 種內鑒定;
           
           
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