香菇子實體在生長過程中常常出現“蠟燭菇”，穴有柄無蓋，雪、“松果菇”、“荔枝菇” ，這些都是香菇的畸形變異菇，大多屬于生理性病害。
畸形菇發生的原因除了菌種低劣或被病毒感染之外，人為方面的原因主要有：
①品種選擇不當。如海拔高的山區應該選擇中、低溫型菌種，如果誤用高溫型菌種，菇蕾在冬季遇低溫便萎縮不長形成“松果菇”。
②發育管理不當。如袋內菇蕾早現，受袋壁擠壓無法正常伸展，第－代菇容易出現畸形。
③脫袋轉色不合標準。
④菌筒浸水不適宜。早熟品種一般出菇２～３批后菌筒的水分開始下降，應及時浸水補液。但有的菇農栽培的是晚熟品種，也跟著浸水。由于晚熟品種正處于形成原基時期，－遇水分刺激就迫使原基提早分化，只長菌柄，從而成了“蠟燭菇”。
⑤控濕保溫不合理。冬季氣溫低，菇床上薄膜罩不平，受寒風襲擊時，正在生長的菇蕾就會萎縮干枯或變異。當相對濕度小于70％時，也會出現菇柄柔軟或空心。
防止辦法
①了解菌性，防止引種失誤。栽培前必須先弄清菌種特性，因地制宜選擇合適的品種，依次安排接種季節，推算好預定的接種時間。
②了解菌絲的成熟特性，防止盲目脫袋。脫袋過早、菌絲未達到生理成熟時，變異菇就多。判斷菌絲是否生理成熟應掌握“一個菌齡、三條標準”，“一個菌齡”就是從接種之日起60天左右， “三條標準”就是袋內瘤狀突起的泡狀菌絲占整個袋面的２／３、局部出現棕褐色、手握菌袋有松軟彈性感。
③掌握轉色規律，防止溫度失控。轉色期間要注意氣溫變化，開始的３天溫度要控制在25℃以內，菇床土的蓋膜不必揭開通風。在正常情況下，12天轉色結束，３天后出現第－潮菇。轉色時的溫度不能低于12℃，也不能高于25℃。出菇的最佳溫度為15℃。
④掌握變溫原理，防止溫差刺激不夠。白天用薄膜罩住菇床，晚上12時以后揭開薄膜１個小時，使日夜溫差在 10℃以上。
⑤及時、適量浸水，防止水濕過早過低。菌筒含水量低于40％時出菇難、小菇多，一般在菌筒的重量比原來下降30％時進行浸水，以吸水后達到制袋時重量的95％為宜。若吸水過飽容易造成菌絲呼吸困難，影響正常長菇。
⑥催菇方法要適當，防止偏干偏濕。每采完一批菇后必須揭膜通風６～７天，使菌絲吸收到充足的氧氣，以恢復生長能力，然后轉入噴水保濕，干濕交替，促下－潮菇蕾發生。
⑦適時采收，防止過熟。在菇蓋有卷邊、菇柄適中時采收，每天采菇一次，到春季產菇高峰期有時可每天采菇兩次。
