工廠化生產的硬件是指構成企業工廠化生產運作系統主體框架的物質基礎。主要包括配料、拌料機械設備、裝瓶（袋）設備、高效滅菌設備、接種設備、培養栽培環境調控設備、采收包裝設備和采后清理設備等。高效、穩定的工廠化生產設備是食用菌工廠化生產正常運作和取得成功的物質關鍵，食用菌工藝裝備的不斷更新，是提高生產效益的關鍵之一。例如裝瓶機從4000瓶/小時提高到12000瓶/小時，接種機也從4頭接種發展到了16頭接種。大大提高了生產效率。金針菇工廠化生產的栽培瓶從850～1000ml、口徑58-65mm，發展到1100～1400ml、 口徑75-82 mm，使金針菇單瓶產量從150-170g提高到250-300g，使栽培技術又上了一個臺階。因此，先進實用的工廠化生產設施設備的不斷突破創新和開發應用，是食用菌工廠化生產發展的核心推動力。
工廠化生產的軟件是指建立標準化的生產管理體系。分三個層次建立標準化的生產管理體系：
首先抓產品標準化。建立產品的企業標準，包括從菌種、原材料一直到產品包裝出廠、運輸、上貨架的整個生產過程的規范要求。與此同時，還要相應制定保證產品達到標準的三套文件，即生產工藝、操作規程及衛生防疫制度。企業標準要堅持高起點，不僅以國內行業標準為基礎,而且盡量與國際先進標準接軌。
其次抓工作標準化。使標準化生產工藝得到切實執行，用工作標準化來保證產品標準化。重點是抓培訓，抓過程，抓反饋，整個生產環節始終處于符合標準要求的穩定可靠狀態。
第三是抓管理標準化。建立ISO9001-2000質量管理體系和HACCP食品安全體系，強調滿足顧客的需求，并爭取以超越顧客期望作為管理原則，變傳統的監督管理模式為自主管理模式，變產品的事后檢驗為對危害的源頭控制。
