滅菌是將料袋內的一切生物利用熱能殺滅的一個過程。這是香菇生產的重要環節之一。目前我國各地香菇生產多采用“古田式”菌棒形式，由于袋口要扎緊密封，不適于高壓滅菌，故多采用常壓滅菌。常壓滅菌多采用土蒸鍋，土鍋爐為蒸氣發生器，這些滅菌方法，勞動強度大、滅菌時間長，不易透，散熱快，常有死角，熱效率低能耗高，在舊有香菇栽培區，一到制棒滅菌期即是“家家滅菌，戶戶冒煙”，大量的有害氣體排放到大氣中，造成嚴重的空氣污染。選用環保低能耗生物質高壓蒸汽鍋爐滅菌技術，是目前較好的辦法。
一、選用環保低能耗生物質高壓蒸汽鍋爐滅菌，采用滾動復合燃燒技術，其優點：①高效節能以再生生物質能源-廢棄的菌棒為主要燃料，使用成本低，比燃油（氣）、優質煤炭降低30-60%的運行成本；②熱效率高：半氣化燃燒加切線旋流式配風設計，低溫分段燃燒，燃燒率達92%以上；③穩定可靠：全自動微正壓運行，不發生回火和脫火現象；④低碳環保：帶有脫塵脫硫裝置，煙塵、硫氮排放低，符合GB13271煙塵排放的要求。同時把廢菌棒用于能源也減少了環境污染；⑤操作簡單：采用自動給料，操作簡單，工作量小，單人值班即可。聯棟雙開門大容積常壓滅菌室設計與建造。
二、聯棟雙開門大容積常壓滅菌室設計與建造：為適應大規模集約型菌棒滅菌需要，從密封保溫性、便于操作、造價低廉等因素綜合設計，①主體建造 ：采用鋼筋水泥砂石混凝土為主材料建造主體結構，厚度24cm，拱形頂15cm。以日產4萬棒規模生產廠需建造體積為：長x寬x高=11m×3.6m×2.5m的滅菌室8棟。每室一次可放入菌棒1-1.2萬。②門體設計：采用主體結構兩端各有兩扇門，可有效避免出入灶工作重疊影響，門體用方管鋼材+雙層耐熱苫布 建造，價格低、輕便、耐用。使用時可密封兩端。③進排氣與溫控系統 ：進氣管從頂部中央進入室內，垂直入下至地面25cm，焊接一根縱向地面有兩排微孔 的出氣管道，這樣熱蒸汽即可直接進入滅菌室底部，進氣量可通過開關閥控制。每扇門體底部留有排氣開關，可及時排出冷空氣、冷凝水。室內留有熱敏探頭，與溫顯器連接，掌握溫度變化。
三、可移動式滅菌框架設計采用立體框架擺放菌棒,克服了傳統直接堆放式滅菌勞動強度大，菌棒間透氣性差，升溫慢，熱傳導慢，滅菌不均勻，滅菌時間長等缺點。立體框架式滅菌：菌棒間有縫隙，透氣性、透熱性好，滅菌時間短，出入灶方便，可以高溫作業，對下一灶菌棒滅菌基礎溫度高，節省能源和滅菌時間，節約勞動力，省工省時降低了生產成本。①建造規格與要求；采用熱鍍鋅方形或圓形厚壁管材焊接成窄框：長x寬x高=2m×0.5m×2.2m，底部安裝腳輪，可人工推動出入灶室，此種規格適于就地凈化接種。另一種規格是寬框：長x寬x高=1.5m×1.1m×1.8m，底部留20cm短腿，可用叉車出入灶室，此種規格適于遠距離運至棚室凈化接種。②數量設計 框每框裝菌棒350---400，一個滅菌室入30個框，放10000棒。寬框每框裝菌棒670，一個滅菌室入16個框，放11000棒。
