預防雜菌污染：①優選栽培料。生料栽培的原料要求干燥、貯存管理好、病菌數量相對較少。如果貯存期限較長，受潮結塊的栽培料含病菌數量會比較多，若未經殺菌處理直接用于生料栽培，則極成雜菌污染。②選擇優質抗性強的品種。③選擇適齡的菌種。菌種發滿菌立即使用，否則會因菌齡過長，形成很厚的老化菌皮或遇到低溫導致種袋大量出菇，使菌絲萌發慢，抗污染能力低、雜菌污染率髙。④控制發菌溫度。平菇適宜發菌溫度為22℃~25℃,溫度高于35℃則菌絲停止生長，溫度高于4℃菌絲會很快死亡，鬼傘等雜菌就會大量發生。因此，發菌期間應注意及時倒垛，嚴防高溫燒堆。發菌溫度低于5℃,平菇菌絲生長很慢，而綠霉菌等雜菌則發生概率高，因此生產中應盡量使菌袋的發菌溫度在適宜的范圍之內。
發酵料袋栽平菇：發酵料袋栽平菇的生產步驟主要有栽培料發酵、菌袋制作菌袋培養和出菇管理。其中，菌袋制作、菌袋培養和出菇管理與生料袋栽培平菇方法相同。栽培料發酵方法如下：建堆建堆場所最好是緊靠菇房的水泥地面，要求排水律堆時，將干料混勻后，按料拋，料維成12米不的科維盡可能一之直來在)在料上氣孔，每03來插一氣發最，用型料薄蓋，成用領苦、精草堆平菇發醇料多在春、秋堆，當料雄中、上月度升550時并保持12~24小時，進行第一次翻堆時將料料松，以增加料中含氧量。
同時，將料內倒外、外內，將上下里外的培養料互換位置，以便培養料均勻發酵。繼制發，料堆中心溫度再次升55℃~60℃并保持24小時，進行第二次翻堆。翻堆3~4次后，培養料開始變色，有酵味，無霉味和臭味，發酵即告結束。最后用pH試紙檢查培養料的酸堿度，再用石灰調整p值為8左右，待料溫降到30℃下時即可裝袋接種。一般全部發酵過程歷時6~8天。氣溫較低時可適當延長發酵時間。發酵時間過長，會大量消耗養分；時間太短，發酵不充分，達不到堆料發酵殺滅害蟲和害菌的目的。
防蟲栽培料堆制發酵時，常吸引菇蠅、菇蚊、家蠅等害蟲在料上產卵，其孵化的幼蟲會危害菌絲體的生長。在翻料時可用80%敵敵畏乳油500倍液，或20%除蟲菊酯乳油3000~5000倍液噴酒，裝袋前可拌入01%敵敵畏溶液，以預防蟲害發生。栽培料發酵主要是促進菌物的有氧代謝，在操作中應注意：①料堆要暄，不能踩壓拍實。②掌握好水分的添加量。當料堆升55℃~60℃時有適量白色菌絲(嗜熱示堆料含水適中，發酵正常放線菌)表示培養料含水太少，應在第一次翻堆時適當添加水分。
生產中應在建堆時一次加足水分，中途最好不再加水，若必須補水，應加80℃以上熱水，加水拌勻后重新建堆發酵。③覆膜的作用主要是保濕，為了增加氧氣供應，宜把膜支架起來。④如果建堆后遲遲達不60℃有可能是培養料加過緊、過實，或因未插孔通氣等原因造成堆料通氣不良，不利水過多于放線菌等嗜熱微生物生長繁殖，致使堆料不能發酵升溫。⑤裝袋時或添加干料含水量適中酵好的培養料要及時使用，以免堆制過久培養料產生游離氨殺發醉料不能有氨味傷菌絲，而且持續較高的料溫，會使培養料的養分大量消耗。
熟料袋栽平菇：熟料袋栽平菇的生產步驟主要有栽培料配制、菌袋制作、菌培養和出菇管理。其中，栽培料配制、菌袋培養和出菇管理與生料袋栽培平菇方法相同。菌袋制作方法：裝袋菌袋一般為長355厘米、寬18厚0.004厘米的低壓聚乙烯或高壓聚丙烯栽培袋，兩頭開口，使22厘米用前先用塑料繩將一頭綁住。小規模栽培時可人工裝袋，裝料時應松緊適度，上緊下松保水透氣，袋壁不留空隙。用尖頭細鋼筋或者木棒在料袋中心部位縱向打孔以利通氣，袋口扎活結。大規模栽培時常用裝袋機裝袋，主要采用小型臥式裝袋機或立式裝袋機裝袋，裝袋需4人操作，1人向裝袋機中上料，1人在出料筒上套袋裝料，2人扎封袋口。
大型專業公司可利用菌袋生產線拌料裝袋，一般為二次拌料，水分、營養較均勻。滅菌將裝好培養料的袋子放入滅菌筐中滅菌，一般采用常壓滅菌。方法是先向常壓滅菌鍋內加水，達到水位線后開始裝滅菌筐，筐與筐間、筐與滅菌鍋壁間留有空隙，保證蒸汽均勻暢通，提高滅菌效果。開始大火猛攻，盡快排盡鍋內冷空氣，避免假升溫現象影響滅菌效果。4~6小時使鍋內料溫達到00后保持8~10小時，滅火后再悶鍋1天左右，利用鍋體余熱繼續殺菌。采用簡易常壓滅菌設備時(蒸汽由爐灶燒水發生，滅菌倉由防雨布覆蓋而成),應延長滅菌時間，料溫達到100℃后保持14~16小時。有條件的可以采用高壓滅菌鍋，料溫達到接種栽培袋滅菌出鋼后搬到潔凈的冷卻室或無菌室內冷卻、栽培料的溫度降到室溫時接種。
在無菌室或者接種帳(用薄膜在溫室或大橫中隔離出30~40米2的相對密閉空間)中接種，接種30分鐘用2%~3%來蘇兒、5%石炭酸溶液噴霧消毒成者打開外燈等對接種工具、栽培袋、空氣消毒。用0.15%高錳酸鉀水溶液擦洗菌種瓶，拔去瓶塞(棉塞)等，用接種鉤去掉菌種表面菌膜，掏出菌種，掰成玉米粒大小的菌種塊。一般兩頭接種，先解開栽培袋一頭袋口，將菌種放入栽培袋內，用塑料繩綁上袋口，或套上直徑8~10厘米的頸圈后再用報紙和膠套將袋口封嚴。倒過來栽培袋，在另一頭接種。接種完畢的栽培袋運到培養室內培養。接種時，操作人員要少說話、少走動，動作要輕、快，以減少污染。平菇熟料栽培中，接種時要注意防止雜菌進入菌袋引發污染，在菌袋出鍋后及時放入干凈的房內冷卻，接種箱內用消毒劑消毒后進行接種，接種速度要快，接種量以覆蓋培養料面為宜，袋口要最好加套環或棉塞，潮濕的棉塞要及時調換，防止棉塞潮濕而引起菌袋污染。
堆制誘發滅菌技術處理栽培料工作原理：堆制誘發滅菌法是集堆制發酵消毒與常壓蒸汽滅菌優點于一身的栽培料滅菌新技術。滅菌原理：①是殺菌而不是抑菌，先誘導雜菌孢子萌發，然后再蒸汽滅菌，將料內雜菌徹底殺滅，保證發菌階段不再污染。②是誘發滅菌不是直接滅菌，滅菌過程包括對雜菌孢子的誘導萌發和滅菌2個階段。③是堆制誘發而不是堆制發酵，料堆升溫主要是促使孢子萌發，不再靠發酵熱殺菌，但同時又具有發酵的一些特點，即經堆制誘發和滅菌的培養料得到腐熟軟化，降低了料中可溶性糖和氮的含量，減少了雜菌孢子賴以迅速萌發和生長的物質基礎。
處理方法培養料的堆制：誘發滅菌處理分堆制誘發和常壓滅菌兩個步驟進行。堆制誘發類似于自然堆制發酵，但重點在于控溫誘導孢子萌發，方法是將拌好的料堆成高08米、寬15米、長不限的垛，上蓋塑料薄膜保濕升溫，即進入堆制升溫誘導孢子萌發階段。當料堆0.4米深處溫度升至40℃~45℃時，揭開薄膜上下翻倒混合均勻，然后再堆成原狀。以后每隔24小時翻垛1次，前后翻堆3次，即可裝袋滅菌。裝袋時垛間應留有空隙，以利熱氣流通。常壓滅菌時，當15厘米處料溫升至95℃時，保持1~3小時(視滅菌量而定，以熱透為準),即可停止給汽，短時蒸汽滅菌即告結束。本方法適于平菇培養料的滅菌處理，可開放接種而不被污染，適宜于高溫季節和種菇老區，特別是污染嚴重的地區采用。
