蘑菇若栽培管理不善，容易遭受病蟲危害，如果防治不及時，會造成嚴重減產。下面介紹蘑菇常見病蟲害防治技術：
蘑菇病菌
1、石膏狀霉菌：在培養料上床后不久便在料面上出現，尤其在床面濕潤、通風不良時會嚴重發生。初顯時為一白色霉狀斑塊，然后斑塊變黃轉褐，最后在斑塊處出現恰似砂粒的黃色粒狀物，具惡臭。防治方法：①要使用發酵良好的培養料；②加強菇房的通風換氣；③出現雜菌時，先撒上一層石灰粉，稍后把受害的培養料或泥粒搬掉，補上新料或新土粒。
2、胡桃肉狀霉菌：此霉菌菇農稱為“菇瘟”，有一種難聞的漂白粉味。一旦發現，應禁止使用，深埋菌種，以防蔓延。當菇床上發現胡桃肉塊雜菌時，要加強菇房通風換氣，減少或停止噴水，并將粒狀的“胡桃肉”并土粒揀凈，待氣溫下降到16℃低溫不利其生長時，才進行噴水。亦可用5％的石碳酸噴射病區滅菌。
對其他雜菌，宜噴水和通風透氣。若將含量50％的多菌靈可濕性粉劑1：800倍，用于培養料拌料，能防治雜菌，還能促進蘑菇菌絲的生長。
菇身的病害屬寄生性病害，目前主要有褐腐病和褐斑病，能造成蘑菇腐爛死亡。發現病菇要及時拔除深埋，嚴重時要進行室內熏蒸消毒。
蘑菇蟲害
1、菌蠅：其成蟲為一小型蠅子，有翅能飛，始期產卵于培養料中，孵化成第二代蛆，侵入脆嫩的菌柄，然后破菌蓋而出，至此把蘑菇咬食成千洞百孔，不能食用。
2、菌螨和紅蜘蛛：菌螨包括粉螨和蒲螨兩種。蒲螨多群棲于土粒表面的凸起處，有如土粒上撒上一層粉狀物；粉螨略大于蒲，群螨棲于土粒上時，宛如撒在土上的一把砂糖。紅蜘蛛群棲時呈深紅色，在土?；蚬缴w上聚集時則似層紅色的粉筆末。
3、潮蟲和跳蟲：潮蟲俗稱“鼠婦”，常在陰潤處食害幼菇及菌褶。跳蟲為一種善跳的小昆蟲，多在培養料和覆土中出現，此蟲在蘑菇子實體上造成小洞。這兩種害蟲還是雜菌的“媒介”。
防治方法：以上害蟲可用如下方法防治，①培養料進房前用40％阿維螨殺凈3500－5000倍液噴霧。②進料前，蘑房要用敵百蟲熏蒸，每百平方米栽培面積用敵百蟲1公斤。③菇房遠離倉庫、雞舍和飼料間，以防病蟲蔓延。④菇房發現螨類時，應在覆土前用40％阿維螨殺凈3500－5000倍液噴殺。
4、線蟲：線蟲喜歡在中溫而潮濕的環境里生活，18℃左右潮濕環境中繁殖最快。但在潮濕的高溫環境里很快死亡。線蟲具有集體游動的特性，用燈光照床面有時可看到白色線狀物在覆土上運動或從土縫中向上爬行，這些白色線狀物就是由一大群線蟲相互盤繞而成。受害處培養料變黑或有臭味。蘑菇床的覆土層或與土粒接觸的料面菌絲大部分消失、發黑變臭，床面出現死菇，死菇區逐漸擴大，死菇的菇蓋變色有臭味，這些都是線蟲危害出現的癥狀。
防治方法：發現線蟲發生后，可用80毫克/千克的硫化鋅噴灑在蘑菇床面。床面經常噴1％濃度的氨水，也有殺菌作用。
5、蛞蝓：適宜在陰濕的環境生活，晝棲夜出。白天潛伏在菇房外陰暗潮濕的雜草叢中或菇房的架料縫隙內。夜晚或白天菇房關閉門窗，停止光照時外出覓食，以晚間10時左右活動較甚，以蘑菇子實體為食物，特別是成熟蛞蝓食量大能將菇體咬成凹陷斑痕，造成幼菇不能正常發育或死亡，成熟菇殘缺不全失去商品價值。
防治方法：①搞好菇房內外環境衛生，剔除雜草，盡量減少蛞蝓的潛伏場所。②經常用石灰粉、漂白粉和草木灰撒在菇房周圍及菇房地板或用5％～10％硫酸銅溶液驅雜。
