【作者】張琦 焦翔 劉香健 張月 張素芳 趙宗保
【機構】中國科學院大連化學物理研究所中國科學院大學
摘要：運用CodonW等軟件,分析了圓紅冬孢酵母Rhodosporidium toruloides基因組中191個蛋白質編碼基因的密碼子使用模式,包括密碼子3個位置上的GC含量、有效密碼子數和密碼子使用頻率。圓紅冬孢酵母有效密碼子數ENc值為38.9,密碼子GC含量為63%,密碼子第三位GC含量為78.3%,且偏好使用G或C結尾的密碼子,確定了圓紅冬孢酵母R. toruloides的21個高表達優越密碼子。研究發現,圓紅冬孢酵母與畢赤酵母、釀酒酵母、大腸桿菌和擬南芥在密碼子使用頻率上有較大差異,而與解脂耶氏酵母和果蠅差異相對較小。研究結果對提高外源基因在圓紅冬孢酵母中表達效率及相關代謝工程和合成生物學研究有一定意義。
基金：國家自然科學基金(31370128； 51761115014)~~；
關鍵詞：密碼子偏好性; 高表達優越密碼子; 密碼子使用頻率; 相對同義密碼子使用度; 有效密碼子數;