常見食用菌中具有保健作用的有靈芝、杏鮑菇、猴頭菇、巴西蘑菇、黑木耳、茯苓、冬蟲夏草、銀耳等各類菌類，具有以下保健作用。
1.抗腫瘤
食用菌普遍含菌多糖和真菌寡糖，具有抗腫瘤活性，如巴西蘑菇、靈芝、茯苓等，是配合放療、化療、手術輔助治療腫瘤，消除放射、化療的副反應，治療神經官能癥良好的保健食品?？茖W研究表明，眾多的高等真菌抗癌新藥的重要來源之一?，F已廣泛栽培的香菇、杏鮑菇、靈芝、灰樹花、猴頭菇等，野生食用菌中的松茸、苦白蹄、云芝等都具有抗腫瘤癌的作用，香菇、金針菇、杏鮑菇和松茸的抗腫瘤癌活性分別達到80.7%，81.1%，86.5%，91.8%。食用菌中抗腫瘤癌的活性成分主要是菌類多糖、多糖肽、雙鏈RNA等。
2.增強免疫力
長期食用菌類食品，能增強機體綜合免疫水平。食用菌的多種藥用作用都是通過這些免疫水平提高達到的，而不是像西藥那樣的快速見效。也正因如此，食用菌成了我國傳統的中藥，在古代多種農書、醫術中都有固本、益氣、補中、解毒等功效的記載，如靈芝、灰樹花等。
3.預防和治療心腦血管疾病
常見的這類疾病有高血壓、高血脂、動脈粥硬化、腦血栓等。長期食用菌類食品，能有效預防這些疾病，對心腦血管疾病患者也有較好的輔助療效。有關醫學研究表明，長期使用香菇、杏鮑菇、平菇、金針菇等食用菌，可以降低人體血清中的膽固醇含量；木耳和毛木耳含有破壞血小板凝聚的物質，可以抑制血栓形成；鳳尾菇通過降低腎小球濾速，起降血壓作用，對腎型高血壓有較好食療效果；靈芝可有效降低人體的血液粘稠度。因此，食用菌是各種心腦血管疾病患者的理想食療食品。主要是由于食用菌中的各種不飽和脂肪酸、有機酸、核算、多糖類物質。
4.保肝解毒、抗菌消炎
食用菌產生多種抗生素，可消炎去痛。肝臟是人體“化工廠”，參與蛋白質合成、化學物質的代謝解毒，靈芝香菇這類對多種實驗性肝臟損傷具有保護作用。
5.降血糖和其他
銀耳、黑木耳、猴頭菇等所含多糖能降低實驗性糖尿病動物的血糖。此外，除上述藥用功能外，食用菌還有抗病毒、調節內分泌、保肝護肝、清熱解毒、鎮靜安神、化瘀理氣、潤肺祛痰、利尿祛濕等功效。
