食用菌具有重要而獨特的健康價值，故國家衛生計生委發布的《中國居民膳食指南2016》中建議，增加菌類食物（食用菌）的攝入。有一部人可能存有這樣的疑問：哪種食用菌營養價值最高？木耳和銀耳哪個更有營養？松茸是最好的食用菌嗎？等等問題。事實上，各種食用菌的外觀、味道、產地、栽培條件都不盡相同，在營養素含量方面也的確存在著差異，但重要的是，它們也有很多相似之處，在營養方面甚至可以用“大致相同”來概括。如果你的食譜還沒有達到天天有食用菌的程度，給你經常吃點食用菌的3個理由。
理由之一，食用菌所含蛋白質，不論含量還是質量都優于普通蔬菜。新鮮或水發食用菌中蛋白質含量為1%-3.5%，略高于一般蔬菜。如水發木耳蛋白質含量為1.5%，新鮮香菇蛋白質含量為2.2%。干制的食用菌因水分減少而使蛋白質含量比例大增，蛋白質含量多為10-30%。
除含量較高外，食用菌蛋白質的質量也較高。食用菌蛋白質含9種必需氨基酸更多，可達約60%。而且其比例與人體內9種必需氨基酸的比例更接近一些，因而利用度較好，營養價值更高。在這方面，食用菌更接近肉類、蛋類等動物性食物，而不是蔬菜、水果等植物性食物。很多人并不知道，在生物學上，真菌雖然一度被錯誤地當作植物，但它們并不進行光合作用，而是從腐化的周圍物質來獲取養分，反倒跟動物很像。
理由之二，食用菌富含微量營養素：如維生素B、維生素B、維生素K、維生素D、鈣、鉀、鐵、鋅和硒等，其中最為獨特的是維生素D。維生素D的主要功能是促進鈣吸收，調節鈣代謝，對骨骼健康至關重要。今年研究還發現維生素D與防治動脈硬化、冠心病、2型糖尿病等常見慢性病有關。
理由之三，食用菌含有一類具有特殊健康價值的成分--菌類多糖：菌類多糖存在于食用菌細胞壁之中，被證明具有提高免疫力、調節血脂、抗癌、抗血栓等作用。其中一些菌類多糖，如香菇多糖、木耳多糖等已經被開發為藥物，應用于臨床。
此外，大部分食用菌含有較多的核苷酸、嘌呤等鮮味物質，故而味道鮮美，適合煲湯、燉煮、炒制等烹飪吃法，甚至還可用于調味。
