在平菇栽培中，病蟲害是攔路虎。認識和及時防治，對正常生產具有重要作用，通常在室內或地道，連續栽培平菇，往往引起蟲害、雜菌的嚴重危害，導致失敗。形成第一次栽培產量高，第二、三次嚴重污染，甚至無收。究其原因，只要有以下兩點：1、因每次栽培后不消毒，平菇生長過程中產生有害代謝物，積累在床架、洞壁上。2、菌絲體衰老，室內或工事陰暗，潮濕、通氣差等原因，引起雜菌孽生、蟲害橫行。
防治方法：1、注意環境衛生，墻壁用5%-6%沖洗、刷凈，地面撒生石灰，或噴灑石灰酸消滅雜菌。另外噴灑殺蟲藥劑，消滅毒蟲。2、用甲醛、硫磺等藥品熏蒸消毒。
