【作者】解凡 趙麗麗 葉麗云 吳小平
【機構】福建農林大學菌物研究中心
摘要：本文以肺形側耳栽培菌株X57為研究對象,利用高通量RNA測序技術對4℃低溫處理0h、6h和12h后的肺形側耳進行基因表達分析來探討肺形側耳低溫應答機制。分析結果篩選出低溫處理6h差異表達基因742個,其中上調表達基因374個,下調表達基因368個;低溫處理12h差異表達基因1 489個,其中上調表達基因占53%,下調表達基因占47%。Gene ontology(GO)功能聚類分析表明,差異表達基因主要富集在結合、催化分子功能組和代謝過程、細胞過程生物學過程中。KEGG功能富集分析結果顯示,差異基因主要富集在氨基酸、核糖體和類固醇生物合成,及氮類物質代謝的通路上,富集到與低溫脅迫相關通路MAPKsignalingpathway-yeast上的基因表達隨低溫處理時間的增加呈上調趨勢。已報道HOG-MAPK通路是MAPK途徑研究較為明確、信號傳遞單一的真菌低溫脅迫中重要的通路,本文運用生物信息學軟件構建肺形側耳的HOG-MAPK通路,并利用熒光定量PCR對相關基因表達進行驗證,結果顯示以低溫處理0h為參照,隨著低溫脅迫時間增加通路上大部分基因的表達量持續上升,且差異顯著,與RNA-Seq分析結果一致。本文通過全面分析肺形側耳低溫脅迫時期基因表達情況,為進一步研究肺形側耳低溫脅迫相關重要基因的功能鑒定與信號通路調控機理提供基礎。
基金：食用菌資源開發和高效加工關鍵技術研究(2018YFD0400200)； 秀珍菇品種選育及安全高效生產關鍵技術研究(KS115009A)~~；
關鍵詞：肺形側耳; 低溫脅迫; 高通量測序; 差異基因; HOG-MAPK通路;